Formålet med DNA Stain Gel i en Elecrophoresis Lab

Når du kjører DNA på agarosegel i et laboratorium, er gelen fargeløs og gjennomskinnelig som en skive av klart jello, og med mindre du flekken det, vil du ikke være i stand til å se ditt DNA. Spesielle fargestoffer som etidiumbromid gjøre DNA-band synlig slik at de skiller seg ut mot bakgrunnen, og du kan bruke plasseringen av bandene til å analysere resultatene.

Fargestoffer

Etidiumbromid er den mest vanlige fargestoff for farging av DNA elektroforese-geler. Det setter seg mellom de to tråder av DNA-molekyler i prøven. Dessverre kan det skli mellom tråder, ikke bare i prøven, men i cellene dine også, så det må håndteres forsiktig; iført doble hansker er en vanlig forholdsregel. Siste årene har sett innføringen av alternative kjemikalier som SYBR Safe også.

fluorescens

Når du har lagt din fargestoff, vil det binde seg til DNA i prøven, slik at den blir svært fluoriserende. Plasser gelen under en svart lys og DNA-band vil gløde brightly, stående ute i levende kontrast til bakgrunnen. Fargestoffet gjør det mulig å se DNA-bånd på gelen, noe som ellers ville være usynlig i den. Det er viktig at du avstår fra å se på eller inn i det svarte lyset mens du ser på gel, fordi UV kan dårlig skade øynene dine.

Analyse

Lab teknikere vanligvis ta bilder av gelen med et digitalt kamera; på det punktet kan de forkaste gel og lagre bildet på harddisken for å vurdere det senere. Du kan fange opp mye informasjon fra stillingen og typer band du ser. Hvis du kjørte størrelsesmarkører på gelen i tillegg til prøven, for eksempel, kan du få et grovt estimat av størrelsen på DNA-molekyler og antall basepar de inneholder.

Andre funksjoner

Hvis du brukte en spesiell type protein til å skjære et stykke av DNA, kan du kjøre den på en gel og se etter flere band i samme kjørefelt for å sørge for at restriksjonsenzymet arbeidet. Alternativt, hvis du arbeider med små løkker av DNA kalles plasmider, og du vil være sikker på et plasmid inneholder et segment du inn i det, kan du klippe det med et spesielt protein og kjøre den på en gel for å sørge for at segmentet var til stede.