Hvordan beregne Allelic Frekvenser

Hvordan beregne Allelic Frekvenser


Gener er segmenter av DNA som koder for proteiner, som er spesialiserte molekyler som utfører et bredt spekter av oppgaver i cellene. Dersom et gen som har mer enn én variant, blir hver variant kalles et allel.

Diploide organismer som mennesker, som har to kopier av hvert gen, kan arve to ulike alleler, en fra hver av foreldrene. Hvis de to arvet alleler er de samme, er de homozygot; hvis lene er forskjellige, er de heterozygote.

Den fraksjon av det totale antall alleler for et gitt gen representerer allel frekvens for en bestemt allel.

Bruksanvisning

1 Bestemme hvor mange alleler er til stede i populasjonen for et gitt gen. Hvis du drive din egen eksperiment, må du ta et utvalg av befolkningen og identifisere varianter av genet til stede i den prøven. Dette er en komplisert prosedyre, og utenfor rammen av denne artikkelen.

Hvis du arbeider dette problemet på en test for en genetikk klasse, bør befolkningen størrelse og antall genvarianter vises i spørsmålet.

2 Finn ut om genet er X-bundet. Hos mennesker og andre pattedyr, en normal mann arver bare én kopi av et gen på X-kromosomet. Hvis du jobber på en genetikk quiz, test eller lekser problem, vil spørsmålet generelt indikere om genet for en egenskap er X-bundet. Hvis det ikke er X-bundet, er det autosomal, noe som betyr at det ikke er på kjønnkromosomene.

3 Velg en bokstav eller symbol for å representere hver av allelene for et gitt gen i beregningene. Ettersom hver enkelt har to kopier av et gen (med mindre det er X-bundet), vil hver enkelt har to alleler.

For eksempel, la oss forestille vi har en befolkning på kaniner som et enkelt gen avgjør om kaninene har hårete eller glatte ører. Dette genet har to alleler: en for hårete ører, og en for glatte ører. I dette tilfellet, kan vi velge bokstaven H som representerer dette genet; en kapital H ville representere den hårete øret allel, og en liten bokstav h vil representere den glatte øret allel.

I dette eksempel kan et individ kanin arve et HH-gen, en Hh-gen, eller en hh-genet.

4 Skriv ned alle mulige allel kombinasjoner for genet. I forrige eksempel, kan kaninene ha kombinasjonene HH, Hh eller hh. Således, er det tre mulige kombinasjoner av alleler for en enkelt kanin. Hvis en kanin har to kopier av det samme allele (f.eks, HH), er det homozygot for det genet. Hvis det har to forskjellige alleler (f.eks Hh), er det heterozygote.

5 Bestem hvor mange individer i befolkningen er homozygot for et allel, og hvor mange som er heterozygot. I vår kanin eksempel, la oss si at vi har 100 kaniner: 50 av dem har HH, 30 har Hh, og 20 har hh.

Forutsatt at vi ønsker å finne frekvensen av allelet H, ville vi være oppmerksom på at 50 kaniner er homozygot for dette allelet (HH), og 30 er heterozygot (Hh).

6 Dele antall homozygote med det totale antall individer i populasjonen.

Dele antall heterozygoter ved 2, og deretter dividere resultatet med det totale antall individer i populasjonen. Til slutt legger begge resultatene til å beregne allel frekvensen.

I vår kanin eksempel, hadde vi 50 kaniner med HH og 30 kaniner med Hh, av 100 totalt antall kaniner. Først deler vi 50 av 100, og får 0,5. Deretter deler vi 30 med 2, og dele resultatet --- som er 15 --- med 100, noe som gir oss 0,15. Sist, legger vi 0,5 og 0,15 for å få 0,65.

Dette er allelet frekvens for H; den forteller oss hva brøkdel av allelene i harepopulasjonens er H, i motsetning til h.