Hvordan beregne isoelektrisk punkt av Peptider

Peptider er korte polymerfragmenter bestående av aminosyrer. Hvert peptid har en bestemt aminosyresekvens, merkes med et tre-bokstav eller en bokstav kode; for eksempel aminosyren alanin er forkortet til "Ala" eller "A" Ladningen av peptidene i oppløsningen er avhengig av løsningen surhet. Det isoelektriske punkt (pI) refererer til oppløsningen surhet verdi hvor peptidet molekylet har den netto ladning på null. Oppløseligheten av peptidet er minimal ved det isoelektriske punkt. Bruk tilgjengelige web-servere for å beregne pi verdi for et peptid-aminosyre-sekvens.

Bruksanvisning

1 Skriv peptidsekvensen ved hjelp av en-bokstavkode. Hvis for eksempel et peptid som har en aminosyresekvens Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (alanin-Serin-Glumatic syre-leucin-prolin), deretter en bokstav sekvens er "ASELP". Om nødvendig ta kontakt med konverteringstabellen tre brev til en bokstav gitt i Resources.

2 Bruk hvilken som helst nettleser, Internet Explorer eller Firefox, for eksempel for å navigere til en server som beregner peptid isoelektrisk punkt (pI); se Resources.

3 Skriv inn peptid ett brev sekvens "ASELP" i vårt eksempel-i-boksen, og klikk på "Compute".

4 Les isoelektrisk punkt (pI) verdien som er angitt i linje "Teoretisk pl / Mw". I vårt eksempel er pi 4,00. Legg merke til serveren beregner også molekylvekten (Mw) av peptidet.