Hvordan måle mRNA

Gener er DNA-sekvenser som koder for proteiner. Celler transkribere gener for å lage mRNA, en form for transkripsjon cellen bruker for å lage et protein. Forskere noen ganger måle nivåene av forskjellige mRNA for å bestemme om et gen som er aktivt i en celle.

typer

Det er flere ulike teknikker for måling av mRNA-nivåer i en prøve. Forskere bruker revers transkripsjon polymerase chain reaction (RT-PCR), Nord-blotting eller mikromatriser.

Funksjon

I Nord-blotting, er RNA-molekyler fra en prøve separeres basert på deres størrelse og deretter overført til en membran, hvor radioaktive prober som er spesifikke for bestemte mRNAer er innført for å bestemme om sine mål er til stede. I RT-PCR, et enzym (et protein som kan katalysere en reaksjon) som kalles revers transkriptase blir brukt til å lage en DNA-kopi av mRNA til stede i en prøve. MRNAene blir deretter kopiert ved hjelp av en prosess som kalles polymerasekjedereaksjonen for å beregne hvor mye av en gitt type mRNA var tilstede. I microarray teknikk, blir mRNA konverteres til DNA med revers transkriptase deretter matchet opp mot en microarray, en rekke DNA-sekvenser. DNA-kopier av RNA-molekyler vil binde seg til DNA-sekvenser som svarer til dem.

betraktninger

Forskere fortsette å utvikle nye teknikker for å analysere mRNA nivåer i en prøve. Nivåer av mRNA er viktige fordi de indikerer hvorvidt et gitt gen blir uttrykt i en bestemt celletype, og hvor det aktive gen er. I tumorceller, for eksempel visse gener kan være overuttrykt i forhold til de samme gener i normale celler, slik at genuttrykksmønstrene kan bidra forskere for å finne mål eller velge den mest hensiktsmessige terapi.