Hvordan Plot en Michaelis-Menten Curve

Hvordan Plot en Michaelis-Menten Curve


Mange biokjemiske reaksjoner er naturlig treg med mindre katalysert av enzymer som øker reaksjonshastigheten. Enzymkinetikk måler enkelt substrat enzymatisk reaksjonshastighet ved å bruke Michaelis-Menten-ligningen, v = [S] Vmax / [S] Km. Michaelis-Menten-ligningen, som er oppkalt etter biokjemikeren Leonor Michaelis og lege Maud Menten, "beskriver forholdet mellom frekvensen av substratet omdannelse av et enzym (V), og konsentrasjonen av substratet ([s])," i henhold til Davidson College Kjemi hjemmeside. Basert på denne ligningen kan den Michaelis-Menten-kurve plottet med x-aksen representerer [S] i millimol og y-aksen representerer V i sekunder / mikromol.

Bruksanvisning

Forstå Michaelis-Menten ligningen

1 Forstå hensikten med hver verdi i ligningen og hva det representerer. V er hastigheten for konvertering eller reaksjonshastigheten, [S] er konsentrasjonen av substratet, er Vmax den maksimale omdannelseshastigheten, og Km (Michaelis konstant) er den substratkonsentrasjon ved hvilken hastigheten av omdannelsen er halvparten av Vmax.

2 Finn verdiene for hver variabel i ligningen. [S] er den kjente konsentrasjonen til substratet blir analysert, og å endre denne verdi vil påvirke graden av enzym-katalyserte reaksjon. Km og Vmax-verdier er vanligvis oppført med underlaget, så vel i form av millimol og sek-1 når gitt i et problem.

3 Løs den passende ligning for hver verdi hvis disse verdiene ikke er gitt. Ifølge Mills College biokjemi nettsted, begynne med steady state ligningen k1 [Efree] [S] = (k-1 + k2) [ES]. Definer Km hjelp av ligningen Km-1 = k1 / (k-1 + k2). Løs for [ES] med ligningen [ES] = [S] [Et] / (Km + [S]) for å få [Ef] og [S]. Bruk [Ef] for å definere Vmax ved hjelp av ligningen Vmax = kcat [Et]. Ta kontakt med en høgskolenivå biokjemi guide eller lærebok for detaljerte instruksjoner om hvordan du kan løse hver av disse ligningene og for spesifikke definisjoner av hver variabel.

4 Sett Km, [S] og Vmax inn Michaelis-Menten ligningen og løse for V, hastighet eller reaksjonshastigheten.

Plotte Michaelis-Menten Curve

5 Ved hjelp av millimeterpapir, tegne en x- og y-aksen. Etikett x-aksen mM [S] eller konsentrasjonen av substrat. Merke y ax- sec / mikro-mol av V eller hastigheten av reaksjonen.

6 Sette inn forskjellige verdier av [S] i Michaelis-Menten-ligningen, sammen med verdiene som ble funnet for Km og Vmax, for å løse for V.

7 Plotte verdier for [S] på x-aksen og de tilsvarende løst verdier for V på y-aksen. Grafen skal se ut som en rektangulær hyperbel hvor høyere konsentrasjoner av substratet likestille til raskere enzymatiske reaksjoner.