Hvorfor må forskere bruker biokjemiske tegn?
Kjemikere, biokjemikere og biologer bruker ofte det som kan høres ut som veldig komplisert terminologi for å beskrive kjemiske reaksjoner og prosesser inne i cellene. Til uninitiated, kan det høres forvirrende eller overflødig å si at en magnesium-avhengig enzym som katalyserer spalting av dets substrat, eller at nitrering av toluen foregår først og fremst i parastilling på grunn av sterisk hindring. Likevel, dette sjargong faktisk tjener en svært verdifull formål.
Begreper
En imponerende rekke reaksjoner og prosesser foregår inni cellene. Viser disse kjemiske reaksjoner og deres resultater er ikke så enkelt som bare skriver den kjemiske formel, fordi to molekyler kan dele den samme kjemiske formel og likevel være svært forskjellige. Det er mange mulige strukturer som svarer til formelen C6H12O, for eksempel, som hver har forskjellige egenskaper fra hverandre. Følgelig har forskere behov for en måte for å beskrive molekyler som illustrerer deres strukturer.
Diagrams
For små molekyler, forskere bruke strukturformler. Disse strektegninger indikere hvordan atomene i molekylet er anordnet på plass i forhold til hverandre, slik at det gir mye mer informasjon enn den kjemiske formelen gjør i seg selv. Større molekyler som proteiner, imidlertid, inneholde tusenvis av atomer, og er enda mer komplisert, slik at strukturformler bli upraktisk. For proteiner, er det ofte mer nyttig å tegne et bånd diagram, som viser hva proteinet ser ut i 3D.
DNA
DNA-molekylet er sammensatt av underenheter som kalles nukleotider. Det er bare fire forskjellige typer nukleotider i DNA; De kan modifiseres kjemisk til en viss grad (noen ganger "denaturert" ved å feste en CH3 gruppe), men i fravær av DNA-skade, hver type nukleotid har samme sammensetning og struktur uavhengig av hvor det vises i DNA-sekvensen. Derfor forskerne representerer ofte de fire typer nukleotider ved hjelp av fire bokstaver for å spare tid. Symbolene i vanlig bruk er A, C, T og G.
Terminologi
Forskere bruker det kan høres ut som komplisert teknologi fordi det forenkler kommunikasjon. Det ville vokse tungvint, for eksempel for å beskrive et gitt protein som "at ett protein med den bølgete struktur som påskynder nedbrytningen av at en 6-karbon-molekyl". Ved å finne opp og bruker bestemte begreper for å beskrive visse typer molekyler, grupper av atomer, strukturer og prosesser, forskere unngå uklarheter og sikre sine kolleger kan forstå den prosessen de ønsker å beskrive.