PCR genotyping Protokoller

Genotyping refererer til bestemmelse av den genetiske koden, eller gener som danner en organisme eller arter. Forskere ofte utføre genotyping gjennom en metode som kalles polymerasekjedereaksjonen eller PCR, som tillater amplifikasjon av en enkelt prøve av DNA inn i flere eksemplarer. PCR genotyping er en vanlig praksis i molekylærbiologiske undersøkelser, som kan anvendes ved forskjellige protokoller, inkludert studier av transgene dyr, mikroorganisme slik som Plasmodium, og fluorescerende merking.

Plasmodium PCR Genotyping

Plasmodium vivax er en mikroorganisme som forårsaker malaria, som berører mer enn 75 millioner mennesker hvert år i Sør-Amerika og Asia, i henhold til "Malaria Journal." Den plasmodium PCR genotyping protokoll involverer analyse av et DNA-fragment betegnet som Pvmsp1, ved bruk av blodprøver og et Qiagen DNA Blood Kit. En oppløsning av Tris-HCl blir brukt til å styres surhetsgrad eller pH-verdi, som skal være på 8,3. Teknikere senere observere prøver under et mikroskop.

Fluorescent Merking av PCR-fragmenter

Teknikere kan analysere lang molekyl-kjeden PCR produktene gjennom en metode som kalles elektroforese. Merking enkelte fragmenter med fluorescerende fargestoffer kan gjøre prosessen mer tidkrevende og resultatene mer nøyaktig. Ifølge The Samuel Roberts Noble Foundation, må minst tre markører, som er fluorescerende-merket DNA-fragmenter, bli analysert i løpet av denne protokollen. Disse markørene er ofte fra forskjellige områder av en prøve.

PCR Genotyping av Transgene Gnagere

PCR genotyping av transgene gnagere er en protokoll som brukes for å detektere transgene DNA i mus. Teknikere trekke DNA fra hale celler og tilsett vann og varme i ett minutt i en tørr bad ved 203 grader Fahrenheit. Senere, plasserer de prøvene på is. PCR-oppløsningen inneholder PCR-buffer-løsning for å kontrollere surhet, nukleotider, som er komponenter av proteiner, genetiske markører primer A og B, og den enzym Taq Polymerase. Deretter teknikerne bland denne løsningen med varmebehandlet DNA og senere utføre analysen, melder University of Michigan Health System.