Hvordan beregne Audpc

Arealet under sykdom Progress Curve (AUDPC) er et kvantitativt mål for sykdom intensitet med tiden. Den brukes i plantepatologi å indikere og sammenligne nivåer av motstand mot sykdommer blant varianter av planter. Den trapes method.is den vanligste måten å beregne AUDPC. Den er utført ved hjelp av en formel utviklet av Campbell og Madden 1990, eller ved å plotte en kurve over prosentandel av infeksjon mot tiden, og å summere trapeser mellom tidsintervaller.

Bruksanvisning

Mål sykdomsprogresjon

1 Forskning regler og retningslinjer som gjelder for måling av spesifikk sykdom og beskjære du undersøke. Den nødvendige størrelsen på anlegget prøven varierer etter avling og sykdom. Studerer sen blight i knoller, for eksempel, krever et minimum prøve av 40 planter.

2 Plante riktig antall planter som kreves for studien.

3 Se nøye etter tegn på sykdommen. Forskning når skiltene er forventet å skje, slik at du er forberedt. For eksempel tegn på sen blight oppstå ca 30 til 40 dager etter planting og 10 dager etter siste påføring av soppdreper.

4 Beregn visuelt andelen infiserte blad område i prøven din så snart du oppdager sykdommen.

5 Registrere prosentandelen av infiserte bladareal ved regelmessige tidsintervaller. Forskere tar lesing for sent blight hver syv dager hvis sykdommen utvikler seg raskere enn forventet. Readings tas hver 14. dag når sykdomsprogresjon er tregere.

6 Stopp innspilling infeksjon målinger når prosentandelen av infeksjonen stopper økende, og sykdomsutviklingen nivåer.

Beregn AUDPC fra en ligning

7 Legg de to første infeksjon prosenter du har tatt.

8 Del tillegg resultatet med to for å finne den gjennomsnittlige eller mid-verdien av de to målingene.

9 Multiplisere den gjennomsnittlige eller midt-verdi av tidsintervallet, som er det antall dager fra den første lesning til det andre lesing. Hvis du tok den første lesing på dag 20 og den andre lesing på dag 27, for eksempel, så antall dager, eller tidsintervall, er sju dager.

10 Spill resultatet i enheter på prosent dager. Verdien er et område av et trapes.

11 Gjenta trinn fire for den andre og tredje infeksjon opplesninger du tok. Deres resultat vil være området av et sekund trapes. Gjenta trinn fire før du beregnet trapesformede områder for alle målingene.

12 Legg alle trapeser for å finne den AUDPC. Lavere AUDPCs representerer tregere sykdomsutvikling og større motstand mot sykdommen. Høyere AUDPCs representerer raskere sykdomsutvikling og høyere mottakelighet for sykdom.

Hint

• AUDPC også er funnet ved å plotte den prosentandelen av infeksjonen mot tiden i et diagram. Arealet av hver trapes mellom målingene blir beregnet ved hjelp av enkel geometri.
• AUDPC åpner for tidsintervaller mellom avlesningene å variere, men målinger bør starte snart etter at sykdommen begynner. Det tar lang tid resulterer i følsomme materialer som ikke utgjør en del av sykdommen fremgang kurve.
• På grunn av den estimering som er involvert i å vurdere den prosentandel av infeksjon, AUDPC ansett som en pseudo-kvantitativt variabel. Den AUDPC er bare et estimat av arealet under selve infeksjon kurve.
• Den AUDPC er ikke generelt sammenlignbare på tvers eksperimenter på grunn av ulike faktorer slik som tilstedeværelsen av skadelige eller fordelaktige sykdomstilstander.