Hvordan sammenligne Gel elektroforese

I å analysere DNA fra forskjellige organismer, må biologer ofte sammenligne lengden av forskjellige fragmenter - enten som en del av DNA-sekvensering og DNA fingerprinting. Den vanligste teknikken for å gjøre dette er kalt gelelektroforese.

Funksjon

DNA er negativt ladet, slik at hvis segmenter av DNA tilsettes til en skive av gel i nærvær av et elektrisk felt, vil fragmentene langsomt vandrer mot den positive elektrode. Kortere segmenter vil reise seg raskere, slik at jo kortere fragment jo lenger det vil reise foran de andre. Gelelektroforese har biologer en måte til å sammenligne lengden av forskjellige segmenter av DNA.

betraktninger

På bakgrunn av gelen, kan DNA-molekylene godt være usynlig. For å sammenligne DNA-fragmentene gjennom elektroforese, trenger en biolog å kunne merke dem først. Noen ganger forskere vil legge til et fargestoff som blir fluoriserende når det er bundet til DNA og utsatt for ultrafiolett lys. Siden DNA inneholder fosfor, kan forskere også merke DNA med 32P, en radioaktiv isotop av fosfor, slik at de kan identifisere de forskjellige fragmentene på gelen og sammenligne dem.

Egenskaper

Gel elektroforese er ofte brukt i etterforskning for å sammenligne DNA-prøver fra en mistenkt med DNA-prøver fra et åsted. Først rettsmedisinske forskere isolere bestemte regioner av genomet som varierer sterkt i lengde fra en person til en annen; disse kalles variabelt antall tandem repetisjoner (VNTRs). Deretter blir disse fragmentene sammenlignes ved hjelp av gelelektroforese. Hvis gel elektroforese viser at de VNTRs fra én prøve er samme lengde som de tilsvarende VNTRs i den andre, er det en kamp.