Hvordan bruke Karplus Curve

Kjernemagnetisk spektroskopi (NMR) er en teknikk som brukes av kjemikere for å undersøke strukturen av molekylene. Atomkjerner i et molekyl oppstår et magnetisk felt som avhenger av deres posisjon i molekylet. Styrken av det magnetiske felt som oppleves av kjernene forandrer frekvensen for radiobølger som de absorberer og avgir. Disse forskjeller i frekvens, som er beskrevet av "kjemisk shift" blir brukt til å bestemme strukturen av molekylet.

I NMR eksperimenter, hydrogenatomer opp til tre bindinger fra hverandre kommuniserer med hverandre på en forutsigbar måte som kalles "J-kobling". Den Karplus ligning, J (phi) = (A

cos ^ 2 (phi)) + (B cos (phi)) + C, beskriver hvordan dihedral vinkel "phi" mellom to hydrogenatomer endrer J-kobling "J." "A", "B" og "C" er konstanter. Ligningen kan plottes å oppnå Karplus kurve. Dette kan brukes til å forstå hvordan "J" forandrer seg med "phi".

Bruksanvisning

1 Skisser en tomt på Karplus ligningen fra 0 til 180 grader, med konstantene "A", "B" og "C" lik en eller referere til en forhåndsdefinert skisse.

2 Tegn et molekyl med to hydrogenatomer som er i forskjellige kjemiske miljøer og tre obligasjoner fra hverandre.

3 Tegn din molekyl så dihedral vinkel "phi" er 0 grader. Bruke Karplus kurve, bestemme relative J-kobling verdi "J."

4 Tegne din molekyl så dihedral vinkel "phi" er 90 grader. Bruke Karplus kurve, igjen bestemme den relative J-kobling verdi "J." Dette vil være mindre enn for 0 grader.

5 Tegne din molekyl så dihedral vinkel "phi" er 180 grader. Bruke Karplus kurve, nok en gang fastslå den relative J-kobling verdi "J." Dette vil være lik verdien for 0 grader.